万寿寺在五塔寺西，创建于明万历五年（1577年），由万历皇帝之母慈圣李太后出资，司礼监冯保选址督建而成，大臣张居正撰写《敕建万寿寺碑文》。明代万寿寺规模宏大、建筑华丽，“几与大内等”。清初顺治十六年（1659年）万寿寺大火，大部分建筑遭焚毁。但经过康熙、乾隆和光绪三朝四度重修、扩建，最终形成了万寿寺中、东、西三路，集寺庙、行宫、园林于一体的庞大规模，占地三万平方米，成为清代皇家祝寿庆典的重要场所，拥有“京西小故宫”之誉。清代宫廷画师绘制的一幅《香林千衲图》为我们展现了乾隆时期万寿寺为皇太后举行万寿庆典时的盛况。当日由千名僧人聚集于寺前诵经，举行千佛道场。在寺院对面的长河南岸建有唱经台，是各寺院高僧、住持、方丈聚集之所，千名来自各方的僧人聚于唱经台两侧。长河北岸、寺门前为宫廷官员们的聚集地。只见图中宫廷官员们正在寺前指挥清扫场地，忙于接待皇帝和皇太后的准备工作；僧众们则云集于长河南岸，人头攒动；唱经台内高僧们正在和官员们寒暄、磋商；万寿寺建筑群则粉饰一新，幡旗高悬，呈现着喜气洋洋的庆典气氛。现在的万寿寺经历数次大修，中路与西路建筑群基本恢复了原有格局，东路则仍待修整。全寺布署严谨，分为中、东、西三路。中路七进院落，中轴线上依次建有山门、天王殿、大雄宝殿、万寿阁（为2002－2003年重建）、大禅堂、假山园林、乾隆御碑亭、无量寿佛殿、光绪御碑亭和万佛楼，主殿的两侧均建有配殿等附属建筑。西路为行宫。寺庙前长河畔恢复了游船码头。