Ostia, nel paleocristianesimo, ebbe il privilegio di essere la seconda diocesi più importante dopo quella di Roma. Il vescovo di Ostia aveva la prerogativa di consacrare vescovo l'eletto pontefice di Roma, e di ungere l'imperatore. Una cattedrale paleocristiana sorgeva nell'area degli scavi di Ostia antica. Dodici vescovi di Ostia sono stati eletti papi. La chiesa di S. Aurea fu ultimata nel 1483, voluta il cardinale francese d'Estouteville che, morendo, lasciò l'incarico di completarla al cardinale Giuliano della Rovere, futuro papa Giulio II. L'architetto fu il fiorentino Baccio Pontelli, che progettò anche il favoloso castello. La cattedrale comunica con l'Episcopio. L'edificio originario era più grande dell'attuale ed era orientato su un asse opposto. Quando fu creata la piazza della Rocca, la chiesa cambiò fronte. È molto bello sostare qui a riflettere, essendo circondati da edifici storici attorno a cui si raccoglie il piccolo, ordinato borgo. La facciata è mossa da paraste decorate alla base con rilievi raffiguranti armi ed oggetti legati alla guerra e al mondo simbolico. Sulla facciata principale sono visibili due stemmi marmorei: sul frontone quello del cardinale Giuliano della Rovere (1483-1503), sull’architrave quello del cardinale Gesualdo (1561-1603), il cui nome compare nell’iscrizione sull’architrave. All’interno, la navata unica è coperta da capriate lignee decorate con gigli; al sopra dell’abside si legge l’iscrizione con la dedica del cardinale Giuliano della Rovere. L'edificio conserva documenti epigrafici del culto della martire Aurea: un cero pasquale marmoreo (V sec.) su cui è incisa l’iscrizione abbreviata del nome latino della santa e una lastra sepolcrale (III-IV sec) in cui lo stesso nome è trascritto in lingua greca (Chryse). Documenti medievali ponevano sul sito la tomba di Monica, madre di S. Agostino. Si ritiene che il luogo dove sorge la chiesa di Sant'Aurea sia quello della sepoltura di Santa Monica, che nel 387 era ad Ostia insieme a suo figlio Agostino. Morì e fu inumata quasi certamente nello stesso luogo dove era stata sepolta Aurea ma poi il corpo di S. Monica fu traslato altrove. Tale tradizione è stata confermata negli anni '50, dal rinvenimento, in loco, di un' iscrizione frammentaria che conserva parte dell’epitaffio in versi dedicato a Monica dal Console Anicio Auchenio Basso nel 408. Aurea (Chryse), vissuta nel terzo secolo d. C. e martirizzata a Ostia insieme a Ciriaco e altri martiri, divenne la patrona dei marinai di Ostia, colei che "porta sulle onde le navi con il vento". Oggi la chiesa di S. Aurea è sede suburbicaria di Ostia (in latino: Ostiensis), una sede della Chiesa cattolica in Italia suffraganea della diocesi di Roma appartenente alla regione ecclesiastica Lazio. Nel febbraio 1984 papa Giovanni Paolo II con la bolla "Si quis" ha ristabilito il capitolo dei canonici della cattedrale ostiense, costituito da un arciprete e undici canonici.